Тихий английский провинциальный городок, известный своей престижной музыкальной школой, живет размеренной и спокойной жизнью, пока три года назад не произошло событие, которое перевернуло его с ног на голову. Юная талантливая скрипачка Сэнди бесследно исчезла, возвращаясь домой через лес на окраине населенного пункта — все поиски не дали никаких результатов, а злополучную рощу огородили...
После событий первого фильма Кларк Кент уже привык к двойной жизни: он работает журналистом в Метрополисе, скрывая от всех свою супергеройскую личность, и строит отношения с Лоис Лейн. Но спокойная жизнь прерывается, когда на Землю прибывают три криптонианских преступника — Зод, Урса и Нона, которые столетиями провели в заточении в Зоне Фантома за противозаконные деяния на Криптоне.