16-летняя Судзумэ живёт в тихой префектуре на острове Кюсю, пока случайная встреча с путешественником не заводит её на заброшенную горную тропу. Там, среди руин, она находит загадочную дверь и, поддавшись любопытству, открывает её. Из проёма вырывается гигантская, почти абстрактная сущность, вызывающая мощное землетрясение, а сам проход остаётся зияющей пустотой, угрожающей превратиться в...
В мире республики Сан-Магнолия длительная война с империей Гиадиан, использовавшей автономные дроны «Легион», подошла к концу. Благодаря собственным разработкам республика объявила о создании беспилотных юнитов, которые должны были положить конец конфликту без потерь среди своих граждан. Эта победа, однако, оказалась мифом, тщательно скрываемым от общественности.
16-летний Ходака Морисима сбегает из дома и оказывается в огромном, враждебном Токио. Без документов он не может устроиться на работу, а бесконечный дождь и тяжёлые тучи создают гнетущую атмосферу отчаяния. Спасение приходит неожиданно: бывший попутчик, работающий в журнале о паранормальном, берёт его к себе и даёт приют.