V век нашей эры. Александрия — шумный античный город, где сталкиваются древняя философия, зарождающееся христианство и власть Римской империи. В этом переломном мире живёт и преподаёт Гипатия (Рэйчел Вайс) — философ, математик и астроном, чей ум и харизма обладают огромным влиянием на политиков и учеников.
«Чёрный орёл» — один из ранних заметных проектов в фильмографии Жан-Клода Ван Дамма, который на тот момент только набирал популярность в Голливуде и еще не получил статус суперзвезды боевиков. Сюжет разворачивается вокруг специального агента ЦРУ, действующего под кодовым именем Чёрный орёл, которого отправляют на небольшой остров Мальта с ответственной миссией.