В недалёком будущем, после череды разрушительных катастроф, мировые лидеры объединяют ресурсы для создания сложнейшей сети орбитальных спутников под названием «Геошторм». Эта система, управляемая из штаб-квартиры в Космосе, призвана стабилизировать климат и предотвращать любые природные угрозы. Однако при первом же серьёзном тесте система даёт сбой, и вместо защиты начинает целенаправленно...
Вторая часть кинофраншизы про элитный отряд спецназа, противостоящий террористической организации Кобра, продолжает историю противостояния героев и их заклятых врагов. После того как отряд G.I. Joe ликвидировал одного из ключевых лидеров Кобры, его бойцы возвращаются на родину, чтобы отчитаться о выполненной миссии, но сталкиваются с беспрецедентным предательством.
Морской пехотинец Логан Тибо прошел три военные миссии в Ираке и чудом остался жив во всех них. Свое везение он связывает с фотографией незнакомой ему женщины, которую нашел на поле боя и носит с собой постоянно. По возвращении в родной город в Северной Каролине он решает отыскать владелицу снимка, не подозревая, что этот шаг кардинально изменит жизнь сразу нескольких человек.