На виду у одноклассников Аму Хинамори из Академии Сейо считается крутой и модной девчонкой, но в душе она тихая, застенчивая школьница, которая боится показывать свои истинные чувства и не умеет строить открытое общение с окружающими. Однажды ночью она решается загадать желание Ангелу-Хранителю — попросить мужества, чтобы перестать притворяться кем-то другим и стать той, кем она всегда хотела...
«Сёстры Минами» — это тёплое и искреннее аниме о повседневной жизни трёх сестёр, оставшихся жить одних в столице Японии. Старшая Харука, ответственная и заботливая, учится в последнем классе школы и старается быть опорой для младших. Средняя Кана, энергичная и непосредственная, погружена в мир средней школы и своих увлечений.
Действие проекта разворачивается в недалеком будущем, когда межгалактические путешествия перестали быть научной фантастикой и стали обыденностью для человечества. На дальних рубежах освоенного космоса расположен стратегически важный аванпост с уникальным временным порталом, позволяющим совершать мгновенные перемещения между удаленными уголками галактики.