События разворачиваются спустя годы после завершения истории об Инуяше и Кагомэ. Това, дочь могучего демона Сэшомару, и её младшая сестра-близнец Сэцуна живут в феодальной Японии, пока лесной пожар не разлучает их. Отчаянные поиски приводят Тову к загадочному порталу, который переносит её в современный Токио, где её находит и воспитывает племянник Кагомэ — Хигураши Сота.
Старшеклассник Такэдзо Курата, последний защитник школьного клуба кото, сталкивается с угрозой расформирования из-за отсутствия участников. Его упорство и любовь к этому древнему струнному инструменту, требующему невероятной концентрации и чувства такта, привлекают самых неожиданных новичков. Среди них — Тика Кудо, громкий и дерзкий хулиган с скрытой глубиной, и Сатова Ходзуки, виртуозная...