16-летний Ходака Морисима сбегает из дома и оказывается в огромном, враждебном Токио. Без документов он не может устроиться на работу, а бесконечный дождь и тяжёлые тучи создают гнетущую атмосферу отчаяния. Спасение приходит неожиданно: бывший попутчик, работающий в журнале о паранормальном, берёт его к себе и даёт приют.
В мире, скрытом от глаз людей, живут крошечные существа — заимствующие. Они осторожно забирают у гигантов то масло, то булавку, то клочок ткани, чтобы выжить. Семья Ариэтти, последних обитателей старого дома под полом, ведёт размеренную жизнь, строго соблюдая главное правило: никогда не быть увиденными.
17-летний Кэндзи Койсо — гениальный программист, который почти всё свободное время проводит в виртуальном мире «Оз», предпочитая общение в цифровом пространстве неловким контактам в реальной жизни. Однажды его уговаривают поехать с одноклассницей Нацуки на юбилей её бабушки в большой семейный дом клана Дзиннан, где хранят старинные традиции и живут несколько поколений родственников.