События разворачиваются на борту обычного пассажирского лайнера, следующий своим курсом в ночное небо. Спокойная обстановка внутри салона, где пассажиры готовятся к долгому перелёту, резко сменяется хаосом, когда самолёт попадает в странную аномалию. Нечто невидимое и зловещее проникает на борт, атакуя людей без предупреждения и пощады.
«Атлантический рубеж 2» — это напряжённый научно-фантастический сиквел, возвращающий зрителя в мир, где человечество снова стоит на грани выживания. Действие разворачивается в Лос-Анджелесе, который подвергается масштабному вторжению новых, ещё более опасных гигантских существ. Если в первой части humanity только училось сражаться, то теперь у него есть шанс на победу: элитные пилоты...